Multigene Panel Testing Reveals Novel Variants in Hereditary Spherocytosis Patients in Türkiye
Ömer Doğru1, Ceren Alavanda2, Şenol Demir2, Ahmet Koç1, Pınar Ata21Marmara University Faculty of Medicine, Department of Pediatrics, Division of Pediatric Hematology and Oncology, İstanbul, Türkiye2Marmara University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics, İstanbul, Türkiye
Objective: This study aimed to determine the genotypic characteristics of patients with hereditary spherocytosis (HS) in Türkiye and to examine the correlation between genotype and phenotype.
Materials and Methods: We analyzed the cases of 18 patients admitted to the pediatric hematology outpatient clinic with hemolytic anemia, jaundice, cholelithiasis, and splenomegaly. According to the Eber classification, the patients’ clinical presentations were categorized as mild, moderate, or severe. Next-generation sequencing was used to analyze single-nucleotide and copy-number variations in all genes associated with HS via clinical exome sequencing. Relationships between the genes with detected variants and the clinical presentations of the patients were investigated.
Results: In total, 21 variants were detected in 5 HS-related genes. Twelve of them were previously reported variants and 9 were novel variants. Seven of them were pathogenic and two were classified as variants of uncertain significance according to the American College of Medical Genetics and Genomics. We discuss the phenotypic effects of novel pathogenic variants in the SPTA1, SPTB, ANK1, SLC4A1, and EPB42 genes. Patients with pathogenic EPB42 and SLC4A1 variants had less severe clinical findings compared to other gene variants according to the Eber classification. On the other hand, patients with pathogenic variants of SPTA1 and SPTB had more severe clinical presentation.
Conclusion: Molecular diagnosis of HS is important for treatment, prediction of the clinical outcome, and appropriate genetic counseling. Our study contributes to knowledge of the genotype-phenotype distribution of HS by introducing novel variants to the literature.
Türkiye'deki Herediter Sferositoz Hastalarında Çoklu Gen Panel Testi ile Yeni Varyantların Saptanması
Ömer Doğru1, Ceren Alavanda2, Şenol Demir2, Ahmet Koç1, Pınar Ata21Marmara University Faculty of Medicine, Department of Pediatrics, Division of Pediatric Hematology and Oncology, İstanbul, Türkiye2Marmara University Faculty of Medicine, Department of Medical Genetics, İstanbul, Türkiye
Amaç: Bu çalışmanın amacı Türkiye’deki herediter sferositoz (HS) hastalarının genotipik özelliklerini belirlemek ve genotip ile fenotip korelasyonunu incelemektir.
Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada, hemolitik anemi, sarılık, safra taşı ve splenomegali ile çocuk hematoloji polikliniğine başvuran 18 hasta incelenmiştir. Eber sınıflandırmasına göre hastaların klinik bulguları hafif, orta ve ağır olarak kategorize edilmiştir. HS ile ilişkili tüm genlerdeki tek nükleotid ve kopya sayısı değişikliklerini analiz etmek için klinik ekzom dizileme kiti ile yeni nesil dizileme yöntemi kullanılmıştır. Hastalarda varyant saptanan genler ile klinik prezentasyon arasında ilişki olup olmadığı araştırılmıştır.
Bulgular: HS ilişkili beş gende toplam 21 varyant tespit edilmiştir. Bunlardan 12’si tanımlı varyantlar, dokuzu ise yeni varyantlardır. Yedi tanesi patojenik olup ikisi Amerikan Klinik Genetik ve Genomik Koleji’ne göre klinik önemi bilinmeyen varyant olarak sınıflandırılmıştır. Bu çalışmada, SPTB, ANK1, SLC4A1, SPTA1 ve EPB42 genlerindeki yeni patojenik varyantların fenotipik etkileri tartışılmıştır. Eber sınıflamasına göre, EPB42 ve SLC4A1 genlerinde patojenik varyantları olan hastalar diğer gen varyantlarına kıyasla daha hafif klinik bulgular göstermiştir. Öte yandan, SPTA1 ve SPTB genlerinin patojenik varyantlarını taşıyan hastalar daha ciddi klinik seyre sahip olmuştur.
Sonuç: HS’nin moleküler tanısı, tedavi, klinik sonucun öngörülmesi ve uygun genetik danışmanlık için önemlidir. Sonuç olarak, çalışmamız literatüre yeni varyantlar kazandırarak HS’nin genotip-fenotip dağılımına katkı sağlayacaktır.
Manuscript Language: English
Copyright © 2025 Turkish Journal of Hematology